Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hoxd13P70217 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hoxd13P70217 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms