Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ufm1P61961 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms