Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnnP61807 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SnnP61807 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SnnP61807 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SnnP61807 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms