Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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