Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp25P57080 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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