Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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