Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PolgP54099 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PolgP54099 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PolgP54099 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PolgP54099 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PolgP54099 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PolgP54099 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms