Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx2P48031 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms