Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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