Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms