Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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RxrgP28705 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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