Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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