Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Hoxd12P23812 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms