Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18533 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18533 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18533 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms