Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P18528 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18528 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms