Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PcnaP17918 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PcnaP17918 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms