Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DmdP11531 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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DmdP11531 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DmdP11531 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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