Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp1P11103 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp1P11103 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms