Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06344 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06344 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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P06344 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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P06344 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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P06344 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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P06344 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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P06344 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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