Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tgfb1P04202 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tgfb1P04202 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tgfb1P04202 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms