Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01822 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01822 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01822 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms