Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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P01649 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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P01649 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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P01649 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P01649 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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