Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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