Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Stra6O70491 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stra6O70491 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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