Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rab33bO35963 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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