Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sp100O35892 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sp100O35892 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sp100O35892 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Sp100O35892 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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