Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif1cO35071 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms