Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20878L7N244 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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