Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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