Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms