Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms