Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Vmn1r167G3UW71 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Vmn1r167G3UW71 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Vmn1r167G3UW71 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vmn1r167G3UW71 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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