Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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