Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms