Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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