Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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