Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Scn7aB1AYL1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn7aB1AYL1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn7aB1AYL1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn7aB1AYL1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn7aB1AYL1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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