Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spocd1B1ASB6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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