Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prr29B1ARI9 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr29B1ARI9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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