Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprsB0V2N1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms