Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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