Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf39A2RT81 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rnf39A2RT81 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf39A2RT81 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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