Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pramef6A2A8M8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms