Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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