Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cldn8Q9Z260 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms