Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gpc6Q9R087 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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