Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms