Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp1Q9QY53 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms