Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms