Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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